Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
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RABGEF1Q9UJ41 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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RABGEF1Q9UJ41 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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RABGEF1Q9UJ41 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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RABGEF1Q9UJ41 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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RABGEF1Q9UJ41 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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RABGEF1Q9UJ41 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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RABGEF1Q9UJ41 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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RABGEF1Q9UJ41 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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RABGEF1Q9UJ41 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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RABGEF1Q9UJ41 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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RABGEF1Q9UJ41 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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