Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF11Q9UIL8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF11Q9UIL8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF11Q9UIL8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF11Q9UIL8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF11Q9UIL8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF11Q9UIL8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF11Q9UIL8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF11Q9UIL8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF11Q9UIL8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms