Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFDP1Q9UEE9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms