Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms