Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms