Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms