Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL9Q9P2J3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms