Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms