Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL28Q9NXS3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms