Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA3Q9NST1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.2 ms