Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL1Q9NSC2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms