Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms