Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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