Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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