Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SHANK2-AS3Q9BTD1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SHANK2-AS3Q9BTD1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SHANK2-AS3Q9BTD1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SHANK2-AS3Q9BTD1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SHANK2-AS3Q9BTD1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SHANK2-AS3Q9BTD1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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SHANK2-AS3Q9BTD1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SHANK2-AS3Q9BTD1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SHANK2-AS3Q9BTD1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SHANK2-AS3Q9BTD1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SHANK2-AS3Q9BTD1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SHANK2-AS3Q9BTD1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SHANK2-AS3Q9BTD1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SHANK2-AS3Q9BTD1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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