Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms