Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP53Q96M91 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms