Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EP400Q96L91 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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