Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms