Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTV1Q96GA3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms