Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM4SF18Q96CE8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms