Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms