Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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GTF3C6Q969F1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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GTF3C6Q969F1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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GTF3C6Q969F1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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GTF3C6Q969F1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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GTF3C6Q969F1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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GTF3C6Q969F1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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GTF3C6Q969F1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF3C6Q969F1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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