Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms