Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VWA5B2Q8N398 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms