Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms