Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms