Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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