Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms