Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms