Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNS3Q68CZ2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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TNS3Q68CZ2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
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TNS3Q68CZ2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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