Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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