Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms