Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms