Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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