Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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ZNF827Q17R98 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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ZNF827Q17R98 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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ZNF827Q17R98 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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ZNF827Q17R98 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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ZNF827Q17R98 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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ZNF827Q17R98 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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ZNF827Q17R98 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF827Q17R98 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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