Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms