Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms