Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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