Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC18A3Q16572 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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