Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms