Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
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