Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms