Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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