Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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