Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRKQ15262 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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