Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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GBX1Q14549 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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GBX1Q14549 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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GBX1Q14549 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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GBX1Q14549 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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