Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDK13Q14004 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms