Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H2Q13888 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms