Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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